Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
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NAE1Q13564 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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