Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NEUROD1Q13562 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEUROD1Q13562 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
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