Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXE3Q13461 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms