Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF1Q13351 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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