Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP140Q13342 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP140Q13342 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP140Q13342 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP140Q13342 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP140Q13342 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP140Q13342 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP140Q13342 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP140Q13342 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP140Q13342 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP140Q13342 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SP140Q13342 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP140Q13342 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP140Q13342 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP140Q13342 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP140Q13342 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP140Q13342 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP140Q13342 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP140Q13342 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP140Q13342 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP140Q13342 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP140Q13342 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP140Q13342 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP140Q13342 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP140Q13342 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP140Q13342 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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