Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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