Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
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CHAF1BQ13112 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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CHAF1BQ13112 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CHAF1BQ13112 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CHAF1BQ13112 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CHAF1BQ13112 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CHAF1BQ13112 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHAF1BQ13112 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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