Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
STX4Q12846 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STX4Q12846 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms