Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM27E3Q08E93 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM27E3Q08E93 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms