Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms