Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms