Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC3A1Q07837 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms