Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPL2Q05D32 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms