Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms