Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms