Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSG4Q00888 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSG4Q00888 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms