Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MYBPC1Q00872 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms