Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM3AP98173 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms