Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRX1P78414 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRX1P78414 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms