Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTG1P63261 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms