Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms