Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPAP53621 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPAP53621 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms