Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLCSP50747 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLCSP50747 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLCSP50747 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLCSP50747 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLCSP50747 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HLCSP50747 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLCSP50747 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLCSP50747 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HLCSP50747 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLCSP50747 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLCSP50747 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLCSP50747 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLCSP50747 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLCSP50747 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLCSP50747 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLCSP50747 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLCSP50747 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLCSP50747 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLCSP50747 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLCSP50747 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLCSP50747 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLCSP50747 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLCSP50747 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLCSP50747 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms