Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP153P49790 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP153P49790 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP153P49790 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP153P49790 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP153P49790 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP153P49790 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP153P49790 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP153P49790 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP153P49790 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP153P49790 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP153P49790 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP153P49790 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP153P49790 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUP153P49790 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUP153P49790 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP153P49790 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUP153P49790 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP153P49790 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP153P49790 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NUP153P49790 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP153P49790 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NUP153P49790 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUP153P49790 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP153P49790 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP153P49790 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP153P49790 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP153P49790 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP153P49790 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP153P49790 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP153P49790 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP153P49790 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP153P49790 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP153P49790 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP153P49790 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP153P49790 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP153P49790 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP153P49790 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP153P49790 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP153P49790 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP153P49790 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP153P49790 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP153P49790 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP153P49790 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP153P49790 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP153P49790 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP153P49790 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP153P49790 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP153P49790 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP153P49790 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP153P49790 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP153P49790 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP153P49790 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP153P49790 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP153P49790 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP153P49790 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP153P49790 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP153P49790 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP153P49790 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP153P49790 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUP153P49790 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP153P49790 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP153P49790 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP153P49790 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP153P49790 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms