Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC6A9P48067 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms