Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP5P45974 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP5P45974 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP5P45974 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP5P45974 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP5P45974 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP5P45974 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP5P45974 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP5P45974 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP5P45974 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP5P45974 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP5P45974 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP5P45974 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP5P45974 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP5P45974 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP5P45974 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP5P45974 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP5P45974 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP5P45974 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP5P45974 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP5P45974 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms