Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATA4P43694 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATA4P43694 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATA4P43694 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATA4P43694 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATA4P43694 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATA4P43694 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATA4P43694 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GATA4P43694 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GATA4P43694 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATA4P43694 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms