Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD52P43351 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAD52P43351 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAD52P43351 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD52P43351 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD52P43351 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD52P43351 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD52P43351 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD52P43351 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD52P43351 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD52P43351 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD52P43351 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD52P43351 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD52P43351 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms