Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPARGP37231 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARGP37231 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms