Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms