Protein–RNA interactions for Protein: P27708

CAD, CAD protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADP27708 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CADP27708 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CADP27708 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CADP27708 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CADP27708 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CADP27708 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CADP27708 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CADP27708 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CADP27708 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CADP27708 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CADP27708 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CADP27708 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CADP27708 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CADP27708 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms