Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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PRKCHP24723 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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PRKCHP24723 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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PRKCHP24723 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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PRKCHP24723 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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PRKCHP24723 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRKCHP24723 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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PRKCHP24723 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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