Protein–RNA interactions for Protein: P23280

CA6, Carbonic anhydrase 6, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA6P23280 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CA6P23280 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CA6P23280 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CA6P23280 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CA6P23280 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CA6P23280 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CA6P23280 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CA6P23280 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CA6P23280 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CA6P23280 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms