Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms