Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms