Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHGAP10645 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHGAP10645 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHGAP10645 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHGAP10645 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHGAP10645 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHGAP10645 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHGAP10645 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHGAP10645 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHGAP10645 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHGAP10645 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHGAP10645 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHGAP10645 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CHGAP10645 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHGAP10645 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHGAP10645 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms