Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms