Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VIL1P09327 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VIL1P09327 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VIL1P09327 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VIL1P09327 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIL1P09327 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIL1P09327 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIL1P09327 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIL1P09327 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIL1P09327 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VIL1P09327 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms