Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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