Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MSMBP08118 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MSMBP08118 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms