Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOA1P02647 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOA1P02647 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOA1P02647 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOA1P02647 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOA1P02647 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOA1P02647 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOA1P02647 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOA1P02647 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOA1P02647 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms