Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-9P01782 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms