Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms