Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM13AO94988 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms