Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP19O94966 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP19O94966 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP19O94966 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP19O94966 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
USP19O94966 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP19O94966 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP19O94966 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP19O94966 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP19O94966 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms