Protein–RNA interactions for Protein: O75971

SNAPC5, snRNA-activating protein complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC5O75971 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC5O75971 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms