Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBOX1O75936 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms