Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms