Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA3O75145 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA3O75145 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA3O75145 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA3O75145 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA3O75145 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA3O75145 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA3O75145 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA3O75145 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA3O75145 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA3O75145 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIA3O75145 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPFIA3O75145 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms