Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EIF5BO60841 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms